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Mise au point de méthodes de manipulation embryonnaire de mollusques bivalves. Application en génétique et pathologie infectieuse ArchiMer
Cadoret, Jean-paul.
Après vingt ans de programmes pivilégiant les méthodes d'élevage, les recherches concernant l'aquaculture, évoluent maintenant vers les domaines de la pathologie infectieuse et la génétique. La maîtrise des productions larvaires a en effet favorisé l'étude de la reproduction et de l'embryologie, et permet désormais d'aborder des travaux expérimentaux sur les différents stades embryonnaires. La polyploïdisation d'oeufs de moules ou d'huîtres a d'abord été envisagée par l'application d'un procédé d'électrofusion. Des expérimentations à grande échelle ont permis l'obtention d'embryons triploïdes (55% chez les huîtres et 36% chez les moules) ainsi que tétraploïdes (20% chez les huîtres et 26% chez les moules). La microinjection de spermatozoïdes a permis de...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusques; Bivalves; Polyploïdie; Electrofusion; Microinjection; Fécondation assistée; Rickettsies; Embryoculture; Trasfert de gène; B-galactosidase; Résistance; Pathologie; Génétique.
Ano: 1992 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00440/55127/56585.pdf
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Mise au point d'outils de gestion des gamètes mâles d'huîtres creuses Crassostrea gigas diploïdes et tétraploïdes à des fins de conservation et de diffusion ArchiMer
Brizard, Raphael; Boudry, Pierre; Haffray, Patrick; Labbe, C.; Suquet, Marc; Robert, Rene; Masse, G.; Pepin, Jean-francois; Saulnier, Denis.
In order to improve oyster culture, many research programs try and propose new methods aiming at improving genetically the product performances and quality (selection, polyploidisation). As for terrestrial animal production, the continuity of the different works as well as the spreading of the genetical progress would be made easier by the development of conservation techniques of the selected genotypes. Cryopreservation, which is often used in selection programs of terrestrial animals or fish farming species, is not always available for bivalves. This technique would enable the conservation of the gametes of individuals selected for their high growth potential, their resistance to diseases and/or their quality for a smaller cost and less risks than the...
Tipo: Text Palavras-chave: Tetraploïde; Diploïde; Concervation; Spermatozoides; Cryoconservation; Génétique; Crassostrea gigas; Huîtres.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/acte-3339.pdf
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Mise en évidence expérimentale de la variance du succès reproducteur chez l'huître creuse Crassostrea gigas (Thunberg) ArchiMer
Boudry, Pierre; Collet, Bertrand; Cornette, Florence; Hervouet, Veronique; Kotoulas, G.; Bonhomme, Francois.
Oysters, like many other marine species, are characterized by very high fertilities. Natural or hatchery populations, often present very low Ne/N ratios (Hedgecock, 1994). It can be explained by very high variances of their breeding success (Li and Hedgecock, 1998), the effective population size being estimated through the temporal variance of the allelic frequencies in natural populations (Hedgecock et al., 1992) or, more directly, through the estimated number of founders in hatchery populations (Launey, 1998). This document is a presentation of the results of a number of experiments, realised in the scope of the European program "GENEPHYS" (FAIR 95-421), and using microsatellite markers to analyse the parental contributions in the flat oyster Crassostrea...
Tipo: Text Palavras-chave: Microsatellite; Succès reproducteur; Contributions parentales; Génétique; Crassostrea gigas; Huîtres.
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1999/acte-3454.pdf
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Mortalités d'huîtres creuses adultes (Crassostrea gigas) et infection à Vibrio aestuarianus - AESTU ArchiMer
Travers, Marie-agnes; Degremont, Lionel; De Lorgeril, Julien; Azema, Patrick; Montagnani, Caroline; Benabdelmouna, Abdellah; Nicolas, Jean-louis; Le Roux, Frederique.
En 2012, le nombre de cas de mortalités d’huîtres creuses adultes rapportés dans le cadre du réseau Repamo, et dans lesquels la bactérie Vibrio aestuarianus a été isolée, a fortement augmenté. Afin d’apporter de premiers éléments de réponse concernant cette augmentation, les objectifs de cette étude étaient de déterminer si l’émergence/la ré-émergence de V. aestuarianus était associée (i) à l’apparition d’un génotype bactérien particulier et/ou (ii) à une sensibilité accrue de certains animaux. L’Ifremer dispose d’une collection de souches bactériennes appartenant majoritairement au genre Vibrio et qui comporte différents isolats de V. aestuarianus, collectés depuis 2001 pendant ou hors épisodes de mortalité. La comparaison de ces isolats en termes de...
Tipo: Text Palavras-chave: Vibrio aestuarianus; Huître creuse; Crassostrea gigas; Bactérie; Ré-émergenece; Virulence; Génome; Statut immunitaire; Génétique.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00229/34037/32430.pdf
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Mortalités estivales et croissance du naissain de l'huître creuse Crassostrea gigas : étude de familles sélectionnées ArchiMer
Degremont, Lionel; Boudry, Pierre; Bedier, Edouard; Ropert, Michel; Soletchnik, Patrick; Huvet, Arnaud; Moal, Jeanne; Samain, Jean-francois.
In the scope of the Morest program, 3 series of bi-parental families of cupped oyster consisting of full and half-sib have been created in 2001, and then studied on a regular basis on several sites over the summer period. In October, major survival differences had been demonstrated between the 3 families. The average survival rate for the half-sib families monitored on the three sites varies from 17 to 97 %. Some of them showed high mortality for the three sites, indicating a strong genetic basis (h2 = 0.81 - 0.29) to the variations observed regarding survival. To a lesser extent, growth differences between the studied half-sib families indicate a weaker heritability for this character. ....
Tipo: Text Palavras-chave: Physiologie; Génétique; Naissain; Sélection; Croissance; Survie; Huîtres; Crassostrea gigas.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3490.pdf
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Niveau de ploïdie des huîtres des bassins de captage de Marennes Oléron et Arcachon (Campagne biovigilance 2007) ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Grouhel, Stephanie; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
The monitoring of spat ploidy collected in the two main collection basins-Marennes Oléron and Arcachon-was realised through flow cytometry. Natural spat samples were collected on 3 sites in each basin and a total of 1 002 animals were analysed. Based on our samples, the results concluded that no polyploid, triploid or tetraploid animals were collected in the two investigated basins. These results comply with our provisions and do not bring any reason for a change in the practices used in triploid oyster culture. However, complementary studies on triploid residual gametogenesis, the nature of their gametes and that of their offsprings will have to be continued in order to fine-tune the estimates of the parameters on which the modeling scenarii of the...
Tipo: Text Palavras-chave: Reproduction; Captage; Arcachon; Marennes Oléron; Génétique; Crassotrea gigas; Huîtres; Naissain; Ploïde.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/rapport-3905.pdf
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Niveau de ploïdie des huîtres des bassins de captage de Marennes-Oléron et Arcachon ArchiMer
Cornette, Florence; Grouhel, Stephanie; Sharbel, Tim; Boudry, Pierre; Goulletquer, Philippe; Lapegue, Sylvie.
La mise en place du réseau « biovigilance » résulte des recommandations formulées dans le cadre de l’expertise indépendante demandée par le Comité Scientifique du Ministère de l’Agriculture et de la Pêche concernant « l’effet d’un flux éventuel d’huîtres tétraploïdes dans les zones conchylicoles ». Il avait été alors préconisé de réaliser « une biovigilance légère, avec mesure régulière du taux d’huîtres tétraploïdes dans les bassins conchylicoles ». Le sous-projet « Réseau biovigilance » s’inscrit dans le projet Ifremer « Typologie et surveillance des systèmes de productions aquacoles » du programme de recherches «Durabilité des systèmes de production » du thème « Surveillance et optimisation des productions aquacoles ». Ce réseau a pour objectif d’être...
Tipo: Text Palavras-chave: Reproduction; Captage; Arcachon; Marennes Oléron; Génétique; Crassostrea gigas; Ploïdie; Huîtres.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15445/12815.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron, Baie de Bourgneuf et Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2011 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Ollier, Simon; Maurouard, Elise; D'Amico, Florence; Seugnet, Jean-luc; Grizon, James.
Comme pour les années précédentes, le réseau biovigilance a réalisé en 2011 la caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2010. Pour la première fois, en plus des deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon, un bassin additionnel (Vendée) a été prospecté via l'analyse de naissains sauvages captés en 2010 au niveau de la baie de Bourgneuf. Les échantillons des naissains sauvages issus du captage naturel ont été prélevés sur les sites de chaque bassin pour un total analysé de plus de 1800 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l'absence d'animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les trois bassins prospectés. Cependant, les bassins de...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Ploïdie; Huître creuse; Crassostrea gigas; Naissain; Analyse cytométrique; Analyse statistique; Bassin de Marennes Oléron; Arcachon; Baie de Bourgneuf.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00107/21837/19427.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2006 ArchiMer
Grouhel, Stephanie; D'Amico, Florence; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
Le suivi de la ploïdie du naissain dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon a été réalisé par cytométrie en flux. Les échantillons de naissain naturel ont été prélevés sur 3 sites dans chaque bassin et pour un total de 1000 animaux analysés. Les calculs de prévalence montrent que les échantillons utilisés durant cette étude nous permettent de détecter, avec une probabilité de 99 pour cent, toute apparition de polyploïdes. Nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l'absence d'animaux polyploïdes dans les deux bassins prospectés. Ils sont donc conformes aux prévisions en la matière et n'apportent aucune raison de modification des pratiques en cours. Cependant, des études concernant la fertilité des triploïdes, la nature de leurs gamètes et de...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Reproduction; Captage; Ploïdie; Crassostrea gigas; Marennes Oléron; Arcachon.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18130/15678.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2008 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Hubert, Mathias; Cantin, Christian; D'Amico, Florence; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
Le suivi de la ploïdie du naissain capté dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et d'Arcachon a été réalisé par cytométrie en flux . Les échantillons de naissain naturel ont été prélevés sur 3 sites dans chaque bassin et pour un total de 1002 animaux analysés. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l 'absence d'animaux polyploïdes. triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Ces résultats sont conformes aux prévisions en la matière et n'apportent donc aucune raison de modification des pratiques en cours dans la filière ostréicole triploïde. Cependant, pour la deuxième année consécutive, les deux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Reproduction; Captage; Ploïdie; Aneuploïdie; Marennes Oléron; Arcachon; Crassostrea gigas.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18131/15679.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2009 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Tourbiez, Delphine; D'Amico, Florence; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
En 2009, La caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2008 dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon a été réalisée dans le cadre du réseau biovigilance. Les échantillons des naissains sauvages issus de ce captage naturel ont été prélevés sur 3 sites dans chaque bassin et pour un total analysé de 1121 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l’absence d’animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Cependant, les deux bassins de captage rospectés sont caractérisés par la présence accrue de naissains affectés de diverses anomalies génomiques (cassures d’ADN et diminution de la taille du génome,...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Génétique; Ploïdie; Naissain; Bassin Marennes Oléron; Charente-Maritime; Bassin d'Arcachon; Gironde.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14282/11559.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2010 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Guyader, Tanguy; D'Amico, Florence; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
Le réseau biovigilance a réalisé en 2010 la caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2009 dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon. Les échantillons des naissains sauvages issus du captage naturel ont été prélevés sur 4 sites dans chaque bassin et pour un total analysé de 1379 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l'absence d 'animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Cependant, les deux bassins de captage prospectés sont caractérisés par la présence de naissains affectés de diverses anomalies génomiques: cassures d 'ADN et Aneuploïdie (hypodiploïdie) ADN c à d une diminution de la taille du...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Reproduction; Captage; Ploïdie; Anomalie génomique; Aneuploïdie.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18124/15677.pdf
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Observatoire national du cycle de vie de l’huître creuse en France. Rapport annuel ECOSCOPA 2017 ArchiMer
Pouvreau, Stephane; Fleury, Elodie; Petton, Sebastien; Corporeau, Charlotte; Lapegue, Sylvie.
Occupant une place de premier ordre dans les paysages côtiers français, l’ostréiculture est le premier contributeur de la filière aquacole française avec une production estimée à 85 000 tonnes ces dernières années. Véritable espèce ingénieur, l’huître creuse, installée en France depuis plus de 50 ans, joue aussi un rôle essentiel sur le plan écologique dans les écosystèmes qui l’abritent. Pourtant, depuis plusieurs années, cette filière subie une baisse de production et les bancs naturels, garants de la diversité génétique, sont mis en danger. Ces phénomènes sont la conséquence directe de l’épizootie causée par OsHV-1 (sous sa forme µVar) affectant les naissains et des mortalités d’adultes associées à la bactérie Vibrio aestuarianus. Ces épisodes de...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Physiologie; Génétique; Ecologie; Réseau National.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00449/56030/57556.pdf
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Observatoire national du cycle de vie de l’huître creuse en France. Rapport annuel ECOSCOPA 2018 ArchiMer
Fleury, Elodie; Petton, Sebastien; Corporeau, Charlotte; Gangnery, Aline; Pouvreau, Stephane.
Occupying a prime position in the French coastal landscape, oyster farming is the leading contributor to the French aquaculture sector with an estimated production of 85,000 tonnes in recent years. However, since 2008, this species has been affected by recurrent massive mortality episodes triggered by the presence of viral infectious agents (of the type Herpes virus OsHV-1 μVar) in conjunction with environmental factors (i.e. temperature rise). This viral infection induces an alteration of the antimicrobial defenses and a destabilization of its microbiota. This process leads to secondary infection by opportunistic bacteria that are potentially pathogenic and multiply rapidly, causing irreversible tissue damage leading to the death of the animal. At the...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Physiologie; Génétique; Écologie; Réseau National.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00634/74654/74826.pdf
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Pathologie des invertébrés marins d'intérêt aquacole. Contribution et stratégies de recherches ArchiMer
Mialhe, Eric.
Les productions d'invertébrés sont prépondérantes en aquaculture marine qui est économiquement très importate pour un grand nombre de pays, notamment de la zone Sud. Cette activité est confrontée à de nombreux problèmes des pathologie qui remettent en cause sa périnnité et son développment. Jusque dans les années quatre-vingt, les travaux relatifs à la pathologie des mollusques et des crevettes ont essentiellement porté sur la description des agents pathogènes. La création en 1985 par l'ISTPM/IFREMER d'un laboratoire pourvu de tous les équipements nécessaires aux techniques de pathologie a permis de mettre en place un programme de recherches orienté vers le contrôle des maladies. Une double stratégie de travail a été alors défine pour apporter  à...
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Immmunologie; Génétique; Mollusque; Crevette; Diagnostic; Epidémiologie; Traitement; Sélection; Transformation génétique.
Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00443/55479/57009.pdf
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Phylogéographie des huîtres de mangrove de l'Océan Atlantique Sud : C. gasar et C. rhisophorae ArchiMer
Heurtebise, Serge; Boutet, Isabelle; Verden, B.; Lapegue, Sylvie; Leitao, Alexandra; Thiriot-quievreux, Catherine; Garica, P.; Boudry, Pierre.
Mangrove oysters include various species that are also present on different coasts. In the southern part of the Atlantic Ocean, Crassostrea rhizophorae has been observed along the southern coast of America and Crassostrea gasar along the western coast of Africa. Fifteen populations of these oysters were sampled from these two geographic areas. Their polymorphism was studied on the 16S mitochondrial fragment both by par sequencing and RFLP analysis. Some samples' caryotype were also analysed. Two haplotypes were identified: C. gasar was found in Africa, but also for the first time in South America, whereas C. rhizophorae was only found on the coasts of South America.
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea rhizophorae; Crassostrea gasar; Huîtres; Génétique; Phylogéographie.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/acte-3278.pdf
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Point sur le programme huître plate - Complément au compte-rendu de réunion REGEMO sur l'Amélioration Génétique de l'huître plate du 11 mars 1998 ArchiMer
Goyard, Emmanuel; Lapegue, Sylvie; Gerard, Andre; Boudry, Pierre.
Ce document vient compéter le rapport REGEMO sur l'huître plate. Une première version visait essentiellement à faciliter le transfert de responsabilité du programme en cours. Celle-ci, épurée des aspects pratiques purement internes, se propose de faire le point sur les familles produites en 1998, et la continuité du programme d'amélioration.
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Sélection génétique; Huître plate; Ostrea edulis; Génétique population; Croissance.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00049/15980/13422.pdf
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Producing recombinant commercial proteins ArchiMer
Cadoret, Jean-paul; Bardor, M; Lerouge, P; Cabigliera, M; Henriquez, Vitalia; Carlier, Aude.
Extraction of natural substances and chemical synthesis are the main sources of pharmaceutical molecules. When possible, one may transfer the gene of the molecule in living cells creating individual factories producing on demand and in a safe way the requested molecule. Today, bacteria, yeast, mammalian cells and plants constitute the main plate-forms for various commercial products. Microalgae present numerous advantages and could offer a powerful tool for the production of commercial molecules in a near future.
Tipo: Text Palavras-chave: Genetics; Recombinant; Algae; Pharmaceuticals; Gene transfer; Biotechnology; Génétique; Recombinant; Algues; Pharmaceutique; Transfert de gène; Biotechnologie.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-4045.pdf
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Programme 3 : Gestion durable des productions ostréicoles : les apports de la génétique. Convention 2000 RPC-A-530 Ifremer - Région Poitou-Charentes ArchiMer
Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Fabioux, Caroline; Lapegue, Sylvie; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Blouin, Frederic; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
L'étude de la variabilité génétique de l' huître creuse Crassastrea gigas est un point essentiel dans la mise en place de programmes de gestion des ressources génétiques et de sélection chez cette espèce. C. gigas, originaire du Japon, a été introduite dans de nombreuses régions du monde et représente aujourd'hui plus de 95 % de la production mondiale d' huîtres. Introduite en France au début des années 1970 pour remplacer l' huître portugaise Crassostrea angulata, c'est aujourd 'hui une ressource de première importance pour notre région. Malgré la maîtrise du cycle de reproduction de l'espèce et son importance commerciale, elle n' a pas été génétiquement améliorée et on peut donc considérer les stocks comme « sauvages» ou « non domestiqués ». De plus, la...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Ressources génétiques; Différenciation génétique; Hybridation; Anomalies chromosomiques; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Crassostrea angulata.
Ano: 2000 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15564/12955.pdf
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Projet ANCRE-DMX2 : Indicateurs biologiques et écologiques pour une gestion durable des stocks de poissons DéMersauX profonds (100–700 m) d’intérêt halieutique à La Réunion ArchiMer
Roos, David; Aumond, Yoann; Huet, Jerome; Bruchon, Franck.
L'usage de la ligne à main mécanisée (moulinet électrique) s'est développé à La Réunion au cours des années 2000. Ce métier s’est développé à la suite d’une campagne de prospection des ressources halieutiques profondes (200-700m), menée conjointement par le CRPMEM et l’Ifremer en 2000. L’objectif de cette campagne par pêche au moulinet électrique visait à identifier de nouvelles ressources démersales à des fins de diversification pour la petite pêche artisanale côtière professionnelle réunionnaise. Ainsi, les premiers résultats de cette étude avaient mis en évidence l'existence de nouvelles espèces et des stocks encore peu exploités à l’époque. Leur exploitation par la pêche professionnelle mais aussi par la pêche plaisancière s’est dès lors développée...
Tipo: Text Palavras-chave: Poissons démersaux; Pêche profonde; La Réunion; Pêche artisanale côtière; Indicateurs biologiques et écologiques; Stock halieutique; Lutjanidae; Bramidae; Epinephelidae; Squalidae; Ligne à main mécanisée; Isotopes stables; Contenus stomacaux; Génétique; Sclérochronologie; Demersal fish; Deepwater fishery; Reunion island; Artisanal fishery; Bio-ecological indices; Fish stock; Lutjanidae; Bramidae; Epinephelidae; Squalidae; Electric reel fishing gear; Isotopic analyses; Stomach contents; Genetic; Sclerochronology.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00347/45812/45553.pdf
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